Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP40Q5TG30 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP40Q5TG30 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARHGAP40Q5TG30 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms