Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LGSNQ5TDP6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGSNQ5TDP6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LGSNQ5TDP6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LGSNQ5TDP6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LGSNQ5TDP6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms