Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATAD3BQ5T9A4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATAD3BQ5T9A4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATAD3BQ5T9A4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms