Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6L9

ERMARD, Endoplasmic reticulum membrane-associated RNA degradation protein, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERMARDQ5T6L9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERMARDQ5T6L9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERMARDQ5T6L9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERMARDQ5T6L9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERMARDQ5T6L9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERMARDQ5T6L9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERMARDQ5T6L9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERMARDQ5T6L9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms