Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIF1Q5T3J3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRIF1Q5T3J3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRIF1Q5T3J3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIF1Q5T3J3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIF1Q5T3J3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms