Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDSS1Q5T2R2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDSS1Q5T2R2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDSS1Q5T2R2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms