Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC122Q5T0U0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC122Q5T0U0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC122Q5T0U0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC122Q5T0U0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC122Q5T0U0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms