Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF19Q5SWL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRAMEF19Q5SWL8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRAMEF19Q5SWL8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRAMEF19Q5SWL8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF19Q5SWL8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms