Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM74A1Q5RGS3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FAM74A1Q5RGS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FAM74A1Q5RGS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM74A1Q5RGS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM74A1Q5RGS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms