Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR38Q5JTN6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR38Q5JTN6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR38Q5JTN6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR38Q5JTN6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms