Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIN4Q56A73 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN4Q56A73 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPIN4Q56A73 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIN4Q56A73 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPIN4Q56A73 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPIN4Q56A73 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIN4Q56A73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIN4Q56A73 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms