Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COBLL1Q53SF7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COBLL1Q53SF7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COBLL1Q53SF7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COBLL1Q53SF7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms