Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC92Q53HC0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC92Q53HC0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms