Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC0

ATP13A5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A5Q4VNC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP13A5Q4VNC0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP13A5Q4VNC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP13A5Q4VNC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP13A5Q4VNC0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A5Q4VNC0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms