Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LONRF3Q496Y0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LONRF3Q496Y0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LONRF3Q496Y0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms