Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNF212Q495C1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RNF212Q495C1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RNF212Q495C1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms