Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMM50Q3ZCQ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMM50Q3ZCQ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM50Q3ZCQ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms