Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
SP6Q3SY56 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SP6Q3SY56 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SP6Q3SY56 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms