Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF1Q17RB8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF1Q17RB8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF1Q17RB8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LONRF1Q17RB8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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