Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RTN1Q16799 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTN1Q16799 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RTN1Q16799 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTN1Q16799 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTN1Q16799 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTN1Q16799 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTN1Q16799 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
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