Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDUFA9Q16795 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NDUFA9Q16795 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFA9Q16795 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFA9Q16795 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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