Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PKN1Q16512 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKN1Q16512 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKN1Q16512 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PKN1Q16512 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKN1Q16512 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
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