Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms