Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CEBPEQ15744 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEBPEQ15744 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEBPEQ15744 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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