Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB35Q15286 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB35Q15286 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB35Q15286 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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