Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSMD6Q15008 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD6Q15008 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD6Q15008 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD6Q15008 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD6Q15008 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
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