Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ODF1Q14990 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ODF1Q14990 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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