Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERV3-1Q14264 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERV3-1Q14264 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERV3-1Q14264 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERV3-1Q14264 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERV3-1Q14264 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERV3-1Q14264 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERV3-1Q14264 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERV3-1Q14264 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERV3-1Q14264 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERV3-1Q14264 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERV3-1Q14264 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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