Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM29Q14134 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM29Q14134 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM29Q14134 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM29Q14134 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM29Q14134 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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