Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNFAIP1Q13829 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNFAIP1Q13829 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNFAIP1Q13829 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TNFAIP1Q13829 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNFAIP1Q13829 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNFAIP1Q13829 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNFAIP1Q13829 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TNFAIP1Q13829 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNFAIP1Q13829 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNFAIP1Q13829 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
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TNFAIP1Q13829 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
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TNFAIP1Q13829 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
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TNFAIP1Q13829 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
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TNFAIP1Q13829 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNFAIP1Q13829 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
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TNFAIP1Q13829 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNFAIP1Q13829 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
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