Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOFQ13790 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOFQ13790 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOFQ13790 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOFQ13790 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOFQ13790 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOFQ13790 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOFQ13790 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOFQ13790 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOFQ13790 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOFQ13790 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOFQ13790 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOFQ13790 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOFQ13790 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOFQ13790 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOFQ13790 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOFQ13790 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOFQ13790 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOFQ13790 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOFQ13790 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOFQ13790 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOFQ13790 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOFQ13790 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOFQ13790 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOFQ13790 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOFQ13790 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOFQ13790 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOFQ13790 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOFQ13790 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOFQ13790 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOFQ13790 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOFQ13790 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOFQ13790 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOFQ13790 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOFQ13790 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOFQ13790 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOFQ13790 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
APOFQ13790 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOFQ13790 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOFQ13790 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOFQ13790 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOFQ13790 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOFQ13790 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOFQ13790 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOFQ13790 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOFQ13790 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOFQ13790 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOFQ13790 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOFQ13790 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOFQ13790 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOFQ13790 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOFQ13790 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOFQ13790 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOFQ13790 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOFQ13790 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOFQ13790 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOFQ13790 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOFQ13790 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOFQ13790 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOFQ13790 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOFQ13790 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOFQ13790 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOFQ13790 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOFQ13790 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOFQ13790 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOFQ13790 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOFQ13790 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOFQ13790 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOFQ13790 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOFQ13790 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOFQ13790 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOFQ13790 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOFQ13790 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOFQ13790 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOFQ13790 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOFQ13790 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOFQ13790 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOFQ13790 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOFQ13790 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOFQ13790 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOFQ13790 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOFQ13790 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOFQ13790 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOFQ13790 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOFQ13790 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOFQ13790 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOFQ13790 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOFQ13790 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOFQ13790 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
APOFQ13790 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOFQ13790 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOFQ13790 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOFQ13790 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOFQ13790 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOFQ13790 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOFQ13790 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOFQ13790 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOFQ13790 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOFQ13790 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOFQ13790 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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