Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CACNA1SQ13698 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CACNA1SQ13698 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CACNA1SQ13698 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CACNA1SQ13698 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CACNA1SQ13698 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
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