Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL4BQ13620 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL4BQ13620 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CUL4BQ13620 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CUL4BQ13620 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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