Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMK2DQ13557 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAMK2DQ13557 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMK2DQ13557 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMK2DQ13557 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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