Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPC3Q13507 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPC3Q13507 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPC3Q13507 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPC3Q13507 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPC3Q13507 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
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