Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SQSTM1Q13501 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SQSTM1Q13501 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SQSTM1Q13501 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SQSTM1Q13501 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
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