Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNTA1Q13424 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNTA1Q13424 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNTA1Q13424 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTA1Q13424 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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