Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF3Q12996 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF3Q12996 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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