Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TWF1Q12792 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TWF1Q12792 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TWF1Q12792 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TWF1Q12792 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TWF1Q12792 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms