Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 MFT1YML062C 1179 nt8.61□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 YNL040WYNL040W 1371 nt8.61□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 NUP57YGR119C 1626 nt8.6□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 EXG2YDR261C 1689 nt8.59□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 ERG24YNL280C 1317 nt8.59□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 GET2YER083C 858 nt8.59□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 OPI1YHL020C 1215 nt8.59□□□□□ -1.03
LSP1Q12230 AFG3YER017C 2286 nt8.58□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 AIM2YAL049C 741 nt8.58□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 LOT6YLR011W 576 nt8.58□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 PPZ2YDR436W 2133 nt8.57□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 RRP43YCR035C 1185 nt8.57□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 BAP3YDR046C 1815 nt8.57□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 SWM1YDR260C 513 nt8.55□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 YOR012WYOR012W 414 nt8.55□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 SPS1YDR523C 1473 nt8.55□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 YCR041WYCR041W 333 nt8.54□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 BDS1YOL164W 1941 nt8.54□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 CDC3YLR314C 1563 nt8.53□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 PSA1YDL055C 1086 nt8.53□□□□□ -1.04
LSP1Q12230 YPT10YBR264C 600 nt8.52□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 YIL108WYIL108W 2091 nt8.52□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 SRF1YDL133W 1314 nt8.52□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 YMR007WYMR007W 381 nt8.51□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 YBL111CYBL111C 2004 nt8.49□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 PPS1YBR276C 2424 nt8.49□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 TDH1YJL052W 999 nt8.49□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 YCP4YCR004C 744 nt8.48□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 YLR112WYLR112W 420 nt8.48□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 SPR1YOR190W 1338 nt8.48□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 RDR1YOR380W 1641 nt8.47□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 CCR4YAL021C 2514 nt8.47□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 PNS1YOR161C 1620 nt8.47□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 CDC7YDL017W 1524 nt8.46□□□□□ -1.05
LSP1Q12230 GNP1YDR508C 1992 nt8.45□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 HHY1YEL059W 309 nt8.45□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 SLG1YOR008C 1137 nt8.45□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 AFG2YLR397C 2343 nt8.45□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 SKP1YDR328C 585 nt8.44□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 PAC10YGR078C 600 nt8.44□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 RCR1YBR005W 642 nt8.44□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 DSC3YOR223W 879 nt8.44□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 OSM1YJR051W 1506 nt8.44□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 ERV2YPR037C 591 nt8.42□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 ADA2YDR448W 1305 nt8.42□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 PSP2YML017W 1782 nt8.42□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 HXT13YEL069C 1695 nt8.41□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 HAC1YFL031W 717 nt8.41□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 FCP1YMR277W 2199 nt8.4□□□□□ -1.06
LSP1Q12230 ELP4YPL101W 1371 nt8.39□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 STS1YIR011C 960 nt8.39□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 SNT309YPR101W 528 nt8.39□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 PGI1YBR196C 1665 nt8.39□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 YMR074CYMR074C 438 nt8.38□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 KIN1YDR122W 3195 nt8.38□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 MTR3YGR158C 753 nt8.37□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 SUN4YNL066W 1263 nt8.37□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 CPT1YNL130C 1182 nt8.37□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 YEL023CYEL023C 2049 nt8.37□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 ARC35YNR035C 1029 nt8.36□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.35□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 NCA3YJL116C 1014 nt8.35□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 CCW12YLR110C 402 nt8.35□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 YOR389WYOR389W 1875 nt8.34□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 RQC1YDR333C 2172 nt8.34□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 ERS1YCR075C 783 nt8.34□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 CYB2YML054C 1776 nt8.34□□□□□ -1.07
LSP1Q12230 IRC5YFR038W 2562 nt8.33□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 NUP84YDL116W 2181 nt8.33□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 YJR142WYJR142W 1029 nt8.33□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 ERG27YLR100W 1044 nt8.33□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 PUP1YOR157C 786 nt8.33□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 PHO85YPL031C 918 nt8.33□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 SEC23YPR181C 2307 nt8.33□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 EFM1YHL039W 1758 nt8.33□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 CEM1YER061C 1329 nt8.32□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 MAS1YLR163C 1389 nt8.32□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 MCH2YKL221W 1422 nt8.31□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 AMN1YBR158W 1650 nt8.3□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 PET117YER058W 324 nt8.3□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 THR1YHR025W 1074 nt8.3□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 NTG1YAL015C 1200 nt8.3□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 STF1YDL130W-A 261 nt8.29□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 TRR1YDR353W 960 nt8.29□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 RPL43AYPR043W 279 nt8.29□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 YPR127WYPR127W 1038 nt8.29□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 YBR241CYBR241C 1467 nt8.29□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 TDP1YBR223C 1635 nt8.29□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 MRPL28YDR462W 444 nt8.28□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 RPL2BYIL018W 765 nt8.28□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 TAD2YJL035C 753 nt8.28□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 ADH6YMR318C 1083 nt8.28□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 CTA1YDR256C 1548 nt8.28□□□□□ -1.08
LSP1Q12230 MSB3YNL293W 1902 nt8.27□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 HRB1YNL004W 1365 nt8.27□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 MIX17YMR002W 471 nt8.27□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 DLD1YDL174C 1764 nt8.27□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 SDH8YBR269C 417 nt8.26□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 NUP53YMR153W 1428 nt8.26□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 GUT1YHL032C 2130 nt8.26□□□□□ -1.09
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