Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC38A11Q08AI6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC38A11Q08AI6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms