Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.32■■■■■ 4.21
GOLGA3Q08378 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
GOLGA3Q08378 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
GOLGA3Q08378 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
GOLGA3Q08378 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
GOLGA3Q08378 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
GOLGA3Q08378 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms