Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
REG3AQ06141 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG3AQ06141 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
REG3AQ06141 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms