Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DEUP1Q05D60 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DEUP1Q05D60 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DEUP1Q05D60 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DEUP1Q05D60 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DEUP1Q05D60 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DEUP1Q05D60 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DEUP1Q05D60 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms