Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROM1Q03395 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ROM1Q03395 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ROM1Q03395 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms