Protein–RNA interactions for Protein: Q03393

PTS, 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTSQ03393 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTSQ03393 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTSQ03393 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTSQ03393 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTSQ03393 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTSQ03393 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTSQ03393 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTSQ03393 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTSQ03393 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTSQ03393 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTSQ03393 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTSQ03393 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTSQ03393 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTSQ03393 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTSQ03393 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTSQ03393 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTSQ03393 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTSQ03393 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTSQ03393 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTSQ03393 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTSQ03393 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTSQ03393 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTSQ03393 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTSQ03393 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTSQ03393 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTSQ03393 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTSQ03393 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTSQ03393 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTSQ03393 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTSQ03393 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTSQ03393 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTSQ03393 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTSQ03393 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTSQ03393 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTSQ03393 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTSQ03393 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTSQ03393 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTSQ03393 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTSQ03393 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTSQ03393 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTSQ03393 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTSQ03393 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTSQ03393 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTSQ03393 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTSQ03393 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTSQ03393 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTSQ03393 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTSQ03393 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTSQ03393 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTSQ03393 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTSQ03393 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTSQ03393 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTSQ03393 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTSQ03393 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTSQ03393 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTSQ03393 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTSQ03393 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTSQ03393 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTSQ03393 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTSQ03393 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTSQ03393 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTSQ03393 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTSQ03393 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTSQ03393 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTSQ03393 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTSQ03393 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTSQ03393 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTSQ03393 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTSQ03393 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTSQ03393 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTSQ03393 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTSQ03393 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTSQ03393 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTSQ03393 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTSQ03393 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTSQ03393 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTSQ03393 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTSQ03393 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTSQ03393 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTSQ03393 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTSQ03393 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTSQ03393 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTSQ03393 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTSQ03393 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTSQ03393 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTSQ03393 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTSQ03393 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTSQ03393 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms