Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NUCB1Q02818 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUCB1Q02818 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUCB1Q02818 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUCB1Q02818 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUCB1Q02818 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms