Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPEQ02224 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPEQ02224 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPEQ02224 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPEQ02224 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms