Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MC1RQ01726 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MC1RQ01726 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms