Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SCN7AQ01118 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SCN7AQ01118 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SCN7AQ01118 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
SCN7AQ01118 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCN7AQ01118 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms